O aplikácii
About the app
littlEye AI je aplikácia pre súdnych lekárov, patológov a študentov medicíny: tréning a vyhodnocovanie AI modelov z mikrofotografií HE preparátov, dataset 27 orgánov s hodnotením kolegami, prípady so súhrnmi, atlas 103 diagnóz, edukačný modul, kvantifikácia obrazu a IHC dezmín s nástrojmi pre štúdiu. Všetko beží výhradne vo vašom zariadení. Aplikácia je zadarmo.
littlEye AI is an app for forensic physicians, pathologists and medical students: training and evaluating AI models from H&E slide microphotographs, a 27-organ dataset with colleague review, cases with summaries, an atlas of 103 diagnoses, an education module, image quantification and desmin IHC with study tools. Everything runs entirely on your device. The app is free.
Podporované zariadenia
Supported devices
| Zariadenie | Device | Minimálny systém | Minimum system |
|---|---|---|---|
| iPhone | iOS 17 | ||
| iPad | iPadOS 17 (tréning je najrýchlejší na modeloch s čipom M)iPadOS 17 (training is fastest on M-chip models) | ||
| Mac | macOS 14 (Apple Silicon odporúčané)macOS 14 (Apple Silicon recommended) |
Kde čo nájdem (4.1)
Where to find things (4.1)
Bočný panel (15 riadkov na Macu, na iPade navyše Nastavenia), menu Prejsť a záložka Viac na iPhone majú rovnaké poradie.
The sidebar (15 rows on the Mac, plus Settings on the iPad), the Go menu and the More tab on the iPhone share the same order.
- PrehľadOverview: ďalší krok, štatistiky, dataset po orgánoch: next step, statistics, dataset by organ ⌘1
- Vyhodnotiť snímkuEvaluate image: prvotná diagnóza (návrh), návrh nálezu: preliminary diagnosis (proposal), report draft ⌘3
- Dataset: 27 orgánov, import snímok, export .le3set: 27 organs, image import, .le3set export ⇧⌘A
- PrípadyCases: sklíčka k prípadu, súhrn: slides per case, summary ⌘2
- HodnotenieReview: hlasovanie kolegov, klávesy 1–9: colleague voting, keys 1–9 ⇧⌘H
- TréningTraining: triedy, profil, výsledok s maticou: classes, profile, result with matrix ⌘4
- ModelyModels: detail, export .le3AI, externý Core ML: detail, .le3AI export, external Core ML ⌘5
- KvantifikáciaQuantification: recepty, polia, body, citlivosť: recipes, fields, points, sensitivity ⇧⌘Q
- IHC dezmínDesmin IHC: dvojica DAB + HE, Index 2, miesta odberu: DAB + H&E pair, Index 2, sampling sites ⇧⌘D
- Denník meraníMeasurement log: zápisy, šarže, ICC, CSV: entries, batches, ICC, CSV ⇧⌘L
- Atlas: 103 diagnóz, hľadanie, filter sústavy: 103 diagnoses, search, system filter ⌘6
- EdukáciaEducation: farbenia, IHC, bunky, pigmenty: stains, IHC, cells, pigments ⌘7
- MetodikaMethodology: tréning modelu · snímanie a hardvér: training a model · capture and hardware ⌘8
- ZdrojeReferences: úplný zoznam citácií: the full list of citations ⌘9
- InfoAbout: manifest, spolupráca, podpora, pôvod dát: manifest, collaboration, support, data provenance ⌘0
- NastaveniaSettings: meno hodnotiteľa, jazyk, ikona, pripomienky, záloha; na Macu: reviewer name, language, icon, reminders, backup; on the Mac ⌘,, na iPade riadok panela, na iPhone vo Viac, on the iPad a sidebar row, on the iPhone under More
iPhone: záložky Prehľad · Vyhodnotiť · Dataset · Atlas · Viac.
iPhone: tabs Overview · Evaluate · Dataset · Atlas · More.
Časté otázky
FAQ
Ako dostanem snímky zo skenera alebo mikroskopu do aplikácie?
Aplikácia číta hotové súbory JPEG, PNG, TIFF a HEIC, nepotrebuje ovládače. Exportujte snímky z programu kamery či skenera a preneste ich cez aplikáciu Súbory (USB-C kľúč, sieťový disk SMB, iCloud Drive) alebo AirDropom; na Macu ich pustite priamo do orgánu v sekcii Dataset. Podrobný postup je v sekcii Metodika → Snímanie a hardvér.
Koľko snímok potrebujem na tréning modelu?
Technické minimum sú 2 triedy po 5 snímok; rozumný začiatok je 30+ snímok na triedu z viacerých prípadov, pri jednom zväčšení. Tréning ukáže pripravenosť každej triedy semaforom; pravidlá sú v sekcii Metodika → Tréning modelu.
Čo je súbor .le3AI a čo .le3set?
.le3AI je prenosný balík natrénovaného modelu: Core ML model + metriky (vrátane konfúznej matice) + audit trail (autor, dátum, triedy). Snímky preparátov nie sú jeho súčasťou. .le3set je zdieľaný dataset sklíčok s diagnózami a hodnoteniami. Oba sú šifrované, zdieľajú sa AirDropom, mailom či cez Súbory a importujú dvojklikom alebo ťuknutím; pred exportom datasetu vidíte, čo sa zdieľa.
Model mi na nové sklíčko dáva nízku istotu: čo s tým?
Najčastejšie príčiny: iné zväčšenie než v tréningu, málo rôznorodých tréningových snímok, alebo nález, ktorý model nepozná. Doplňte snímky danej triedy (ideálne z viacerých prípadov), držte jedno zväčšenie a sledujte konfúznu maticu v detaile modelu; ukáže, ktoré triedy si model zamieňa. Výsledok je vždy návrh s istotou v percentách, nie verdikt.
Ako zmeriam dezmín z dvojice snímok (DAB + HE)?
Sekcia IHC dezmín. Do slotu DAB načítajte sken alebo mikrofotografiu rezu farbeného DAB, do slotu HE fotku toho istého bločku farbeného HE, pri rovnakom zväčšení. Index 2 sa prepočíta hneď; aplikácia skontroluje kvalitu oboch snímok a porovnateľnosť dvojice. Hodnoty zapíšete do vybraného miesta odberu tlačidlom; nič sa nepridáva automaticky. Z Kvantifikácie sa snímka prenesie cez Otvoriť v dezmíne → DAB / HE.
Ako si zálohujem a obnovím dáta?
Nastavenia → Záloha (na Macu ⌘, → Záloha; na iPade riadok Nastavenia; na iPhone Viac → Nastavenia). Zálohovať archív… zapíše do vybraného priečinka (externý disk, USB-C, sieťové úložisko) kompletnú zálohu: register, snímky, modely, denník meraní aj šarže. Obnoviť zo zálohy… ju načíta späť.
Kde je sekcia Hardvér a kde Nástroje?
Hardvér je druhou záložkou sekcie Metodika (Tréning modelu · Snímanie a hardvér). Nástroje sú v skupine Výskum: Kvantifikácia, IHC dezmín a Denník meraní, každý ako samostatná sekcia.
Je aplikácia zdravotnícka pomôcka?
Nie. Výskumný a podporný nástroj. Nie je zdravotnícka pomôcka. Finálne posúdenie vždy patrí patológovi či súdnemu lekárovi.
How do I get images from a scanner or microscope into the app?
The app reads ready-made JPEG, PNG, TIFF and HEIC files, no drivers needed. Export the images from your camera or scanner software and move them via the Files app (USB-C drive, SMB network share, iCloud Drive) or AirDrop; on the Mac drop them straight onto the organ in the Dataset section. The detailed procedure is under Methodology → Capture and hardware.
How many images do I need to train a model?
The technical minimum is 2 classes of 5 images each; a sensible start is 30+ images per class from several cases, at one magnification. Training shows the readiness of every class with a traffic light; the rules are under Methodology → Training a model.
What is a .le3AI file and what is a .le3set?
.le3AI is a portable package of a trained model: the Core ML model + metrics (including the confusion matrix) + an audit trail (author, date, classes). Slide images are never part of it. .le3set is a shared slide dataset with diagnoses and reviews. Both are encrypted, shared via AirDrop, mail or Files and imported with a double-click or a tap; before exporting a dataset you see what gets shared.
The model gives low confidence on a new slide: what now?
The most common causes: a different magnification than in training, too few varied training images, or a finding the model does not know. Add images of that class (ideally from several cases), keep one magnification and watch the confusion matrix in the model detail; it shows which classes get mixed up. The result is always a proposal with a confidence in percent, never a verdict.
How do I measure desmin from an image pair (DAB + H&E)?
The Desmin IHC section. Load a scan or microphotograph of the DAB-stained section into the DAB slot and a photo of the same block stained with H&E into the H&E slot, at the same magnification. Index 2 is recomputed at once; the app checks the quality of both images and whether the pair is comparable. You write the values into the chosen sampling site with a button; nothing is added automatically. From Quantification the image travels via Open in desmin → DAB / H&E.
How do I back up and restore my data?
Settings → Backup (on the Mac ⌘, → Backup; on the iPad the Settings row; on the iPhone More → Settings). Back up archive… writes a complete backup into the chosen folder (external disk, USB-C, network storage): register, images, models, measurement log and batches. Restore from backup… loads it back.
Where are the Hardware section and the Tools?
Hardware is the second tab of the Methodology section (Training a model · Capture and hardware). The tools are in the Research group: Quantification, Desmin IHC and Measurement log, each as its own section.
Is the app a medical device?
No. Research and decision-support tool. Not a medical device. The final assessment always belongs to the pathologist or forensic physician.
Spolupráca a validácia
Collaboration and validation
Aby modely a kvantifikačné metódy niečo znamenali, potrebujú overenie na cudzom materiáli: inom skeneri, inom laboratóriu, iných rukách. Žiadne poplatky, žiadny zber dát. Ponúkame aplikáciu zadarmo na prácu, hotový návrh validačnej štúdie a spoluprácu.
For the models and quantification methods to mean anything, they need verification on someone else's material: a different scanner, a different laboratory, different hands. No fees, no data collection. We offer the app free for your work, a ready validation-study proposal and collaboration.
Návrh multicentrickej validácie kvantifikácie dezmínu
Proposal: multi-centre validation of desmin quantification
Rovnaký postup platí aj pre iné farbenia. Otázka: dáva littlEye AI na rôznych pracoviskách zhodné a reprodukovateľné čísla, a pridáva Index 2 niečo k holému CPA?
The same procedure applies to other stains. The question: does littlEye AI give consistent, reproducible figures across institutions, and does Index 2 add anything to a bare CPA?
- Sériové rezy z ≥ 3 miest srdca: dezmín (DAB) a susedný HE; sken celého výrezku alebo mikrofotografie pri rovnakom zväčšení.
- Serial sections from ≥ 3 cardiac sites: desmin (DAB) and the adjacent H&E; a whole-section scan or microphotographs at the same magnification.
- Spoločný uzamknutý protokol (vektory farbív, prah Otsu alebo dohodnutý ručný, mierka); rovnaké nastavenie overí kontrolný súčet.
- A common locked protocol (stain vectors, Otsu or an agreed manual threshold, scale); identical settings verified by the settings checksum.
- Kontrolné sklíčko v každej šarži farbenia; zaslepené meranie dvoma hodnotiteľmi, ≥ 20 % prípadov dvakrát → ICC a Bland–Altman.
- A control slide in every staining batch; blinded measurement by two raters, ≥ 20 % of cases twice → ICC and Bland–Altman.
- Meranie po poliach a overenie prahu bodovým sčítaním; koordinátorovi ide len CSV z denníka. Snímky sa neposielajú.
- Measurement across fields and threshold verification by point counting; only the log CSV goes to the coordinator. Images are not sent.
- Výstupy: medzipracoviskový ICC pre CPA a Index 2, zhoda s bodovým sčítaním, ROC Indexu 2 vs. CPA. Spoluautorstvo pre každé zapojené pracovisko.
- Outputs: inter-institution ICC for CPA and Index 2, agreement with point counting, ROC of Index 2 vs CPA. Co-authorship for every participating institution.
Hľadáme aj HE a IHC preparáty s jasnou licenciou na zdieľanie a pracoviská s iným skenerom. Ponúkame spoluautorstvo, poďakovanie v aplikácii a modely zadarmo, bez poplatkov a bez zmluvy o dátach. Celý návrh je v aplikácii (Info → Spolupráca a validácia) a dá sa skopírovať ako text.
We are also looking for H&E and IHC slides with a clear licence to share, and for departments with a different scanner. We offer co-authorship, credit in the app and models free of charge, no fees and no data agreement. The full proposal is in the app (About → Collaboration and validation) and can be copied as text.
Kontakt
Contact
Otázky, hlásenia chýb aj návrhy na vylepšenie posielajte na:
Questions, bug reports and suggestions are welcome at:
admin@forensika.euadmin@forensika.eu
MUDr. Ján Šikuta, PhD., súdny lekár. Do správy prosím uveďte zariadenie, verziu systému a verziu aplikácie (sekcia Info).
Ján Šikuta, MD, PhD, forensic physician. Please include your device, OS version and app version (About section) in your message.